榮譽院長		專長
徐國士	83/8/1：自然資源管理研究所創所所長	植物生態、自然資源保育、國家公園管理

歷任院長	任期	專長
夏禹九	99/8/1~104/7/31	森林水文、氣象，地景生態，集水區經營
裴家麒	104/8/1~107/7/31	野生動物族群生態學、經營管理及保育、哺乳動物學、保育人文學、野生動物研究方法學
陳紫娥	107/8/1~108/1/31(代理)	基礎環境、環境地學、土地資源之調查與評估、自然危險及其評估、環境影響評估
張文彥	108/2/1~迄今	地震、地球物理學、地震防災、遙測科技